科学方法是一种有纪律的、系统的方式来询问和回答有关物理世界的问题。尽管将科学方法视为一系列简单的步骤是有用的，但科学方法没有一个单一的模型可以应用于所有情况。相反，不同的科学研究需要不同的科学方法。然而，某些品质必须适用于科学方法的所有应用。
科学调查的一个重要品质是它必须试图回答一个问题。换句话说，调查不应该试图“证明”一个观点，而应该获得知识。另一个特点是，仔细、有控制的观察必须构成信息收集的基础。最后，科学调查的结果必须是可重复的：使用相同过程的其他研究人员必须观察到相同的结果。如果结果不可重复，则必须对原始结论提出质疑。
疫苗研究的科学方法的历史导致了今天精心监管的疫苗开发过程。多年来，疫苗研究的标准越来越严格，以使对照组和疫苗组尽可能相似。控制、盲法和随机化原则在疫苗测试方式中起着关键作用。