通过新的快速检测可以挽救类鼻疽病的生命

在全球范围内，超过一半的患者在感染被忽视的热带病类鼻疽后死亡，通常在他们被诊断出来之前。一种新的快速检测可以通过在数小时内诊断患者来挽救生命，而不是用目前的细菌培养方法需要几天的时间，这意味着他们更快地接受正确的抗生素。

该测试使用CRISPR来检测对伯克霍尔德氏菌（引起类鼻疽的细菌）特异性的遗传靶标，灵敏度为93%。它是由玛希隆-牛津热带医学研究单位（MORU）、清迈大学、泰国Vidyasirimedhi科学技术研究所（VISTEC）和英国惠康桑格研究所的研究人员开发的。

发表在《柳叶刀微生物》上的研究结果意味着，通过一种可以在全球范围内推广的快速、易于使用的诊断测试，可以挽救更多生命。

类鼻疽是一种被忽视的热带疾病，据估计，全世界每年有165,000人受到影响，其中89,000人死于这种疾病。它是由假马氏伯克霍尔德菌引起的，它生活在热带和亚热带地区的土壤和水中，通过皮肤擦伤、食入或吸入通过接种进入人体。

类鼻疽很难诊断，因为症状从局限性脓肿或肺炎到急性败血症不等，或者可能表现为慢性感染。因此，以及它主要影响的农村地区孤立社区的位置，这种疾病仍然被严重低估。

目前，类鼻疽是在细菌样本培养后诊断出来的，这需要三到四天的时间。在泰国，大约 40% 的类鼻疽患者死亡，其中许多人在入院后的头一到两天内死亡，同时等待诊断。

目前尚无针对类鼻疽的许可疫苗，但在治疗的第一个强化阶段，患者可以静脉注射抗生素（头孢他啶或碳青霉烯类）进行有效治疗。然而，目前的做法通常涉及最初使用一系列不必要的抗生素治疗患者，以针对疾病产生的各种症状，这可能会浪费时间和资源。

在一项新的研究中，该团队着手开发一种新的快速测试，以减少正确诊断和治疗类鼻疽患者所需的时间。

研究人员通过分析3000多个假马莱双歧杆菌基因组，确定了假马莱双歧杆菌特异性的遗传靶标，其中大部分是在桑格研究所测序的。他们搜索了基因组的保守区域，并针对其他病原体和人类宿主基因组筛选了靶标，以确保他们选择的靶标对假马莱芽孢杆菌具有特异性。

他们的测试称为CRISPR-BP34，涉及破裂细菌细胞并使用重组酶聚合酶扩增反应来扩增细菌靶DNA以提高灵敏度。此外，CRISPR反应用于提供特异性，并采用简单的侧向流动“试纸”读数来确认类鼻疽病例。

为了评估该测试的有效性，研究小组收集了114名类鼻疽患者和216名未患鼻疽患者的临床样本，该医院位于泰国东北部，类鼻疽流行。然后将CRISPR-BP34测试应用于这些样品。

新测试显示灵敏度增强，达到93%，而细菌培养方法为66.7%。它还在不到四个小时内提供尿液、脓液和痰液样本的结果，并在一天内提供血液样本的结果。与目前的细菌培养诊断方法相比，这是一个显着的改进，该方法通常需要三到四天。

这种新的快速诊断测试将使卫生专业人员能够更快地开出正确的抗生素，这意味着更少的患者在等待诊断时死亡。在节省宝贵时间的同时，新测试还将节省资源和金钱，减少不必要的抗生素处方，并减少患者在医院的时间。

在团队的下一步中，他们目前正在设计随机临床试验，以显示这些测试在医院环境中的有效性。此外，该团队的成员将开始研究人类遗传学在类鼻疽感染的易感性和免疫反应中的作用。

泰国Mahidol-Oxford热带医学研究单位（MORU）的共同主要作者、Wellcome Sanger研究所国际研究员Claire Chewapreecha博士说：“在泰国农村工作有很多局限性。但我们已经证明，局限性孕育创新，在这里成功的东西可以在任何地方成功。

“我为这种新的、强大的、快速的类鼻疽诊断测试背后的团队感到非常自豪，我希望它可以在世界任何地方使用，以更快地为患者提供正确的治疗，最终挽救生命。”

泰国清迈大学的共同主要作者Somsakul Wongpalee博士说：“我们精心设计了基于CRISPR-BP34的快速诊断测试，并采用了强大的算法，并在体外测试了其性能。我们很高兴CRISPR-BP34测试在临床样本上测试时表现出出色的诊断功效，展示了其对患者预后产生重大影响的潜力，并可能在不久的将来挽救生命。

资深作者、惠康桑格研究所寄生虫和微生物负责人Nick Thomson教授说：“这项研究证明了国际合作以及基因组学的大规模应用如何导致临床干预。使用从数千个细菌基因组库中挖掘的遗传靶标，该团队能够产生一种非常敏感的测试，该测试对类鼻疽背后的细菌具有特异性。我期待看到这项研究的临床影响。

资深作者兼泰国Mahidol-Oxford热带医学研究部（MORU）和泰国Wellcome Trust亚洲和非洲计划主任Nick Day教授说：“尽管类鼻疽在亚洲许多地方死亡率高，发病率高，但一直被忽视。早期诊断至关重要，这样才能尽快开始所需的特定治疗。通过此次合作开发的新型快速诊断工具有可能改变游戏规则。