研究使用一种新的快速检测方法在韩国发现了汉坦病毒

正汉坦病毒是高度传播的人畜共患病原体，因在欧亚大陆引起肾综合征出血热（HFRS）和在美洲引起汉坦病毒心肺综合征而臭名昭著。它们对公共卫生具有重大影响，已被广泛研究用于有效的疫情控制和干预策略。

韩国京畿道报告了大量HFRS病例，使其成为流行病学监测和了解正汉病毒基因组多样性的关键地区。

为了深入了解流行情况，病毒载量韩国大学医学院微生物学系Jin-Won Song教授领导的研究小组在京畿道进行了一项研究。

值得注意的是，该研究展示了Flongle测序的应用，这是一种创新、经济、快速的检测HTNV基因组的方法。

“我们使用基于纳米孔的Flongle芯片开发了一种快速灵敏的现场诊断方法，成本约为100美元。宋教授解释说:“这种方法可以在3小时内完成HTNV的全基因组测序。”他们的工作最终产生了一个研究论文发布于医学病毒学杂志.

这项研究的方法植根于采用下一代测序技术，重点是牛津MinION纳米孔测序仪。全面的采样策略包括使用活诱捕器从韩国不同地区捕获啮齿动物和鼩鼱。

随后，该团队采用了一种多方面的方法，包括线粒体DNA分析、间接免疫荧光抗体测试和各种用于物种鉴定和病毒检测的分子方法。这种综合方法有助于全面了解病毒流行情况遗传多样性.

2017年至2018年在京畿道进行的流行病学监测发现了很大比例的黑线姬鼠，这是一种常见的啮齿动物。值得注意的是，12.4%的黑线姬鼠表现出HTNV血清阳性，表明该地区存在该病毒。

絮状测序证明有助于获得全长基因组序列来自阳性样本，其覆盖率和准确性令人印象深刻，可与Illumina测序相媲美。系统地理学分析揭示了HTNV三重基因组之间得到充分支持的进化差异。遗传聚类和进化模式中的不一致强调了病毒在每个基因组片段中的差异进化。

宋教授强调了这项研究的重要性，他说:“我们相信我们的发现为现场诊断、基于基因组的监测和原汉病毒的进化动力学提供了重要的见解，以缓解韩国HFRS流行地区的汉坦病毒暴发。”

“我们的研究率先将经济高效的Flongle测序整合到汉坦病毒诊断中，为现场检测提供了快速准确的工具。这一创新有可能改变我们应对和管理汉坦病毒疫情的方式。”

尽管该研究提供了突破性的见解，但研究人员承认存在某些局限性，包括需要对基于Flongle的诊断进行进一步的敏感性测试，以及在某些流行地区需要更广泛的基因组和流行病学数据。

这项研究标志着我们对正汉病毒的理解向前迈出了重要一步，为针对HFRS疫情采取更有针对性的控制策略奠定了基础。这些发现强调了基因组学在疾病监测中的关键作用，并为未来更有效地应对新出现的传染性病原体带来了希望。