科学家竞相对百日咳疫苗做出最佳预测
科学家喜欢挑战。或者是一场友谊赛。现在,拉霍亚免疫学研究所(LJI)的科学家最近公布了一项竞赛的结果,该竞赛对研究人员进行了测试。作为免疫计算模型网络的一部分,来自不同机构的研究人员团队提供了他们对百日咳芽孢杆菌(百日咳)疫苗接种的最佳预测。
每个团队都试图在不同的临床研究参与者中回答有关疫苗反应的相同问题。哪些研究参与者在接种疫苗后 14 天对百日咳芽孢杆菌毒素表现出最高的抗体反应?哪些参与者在接种疫苗后一天血液中的单核细胞增加最多?等等。
研究小组在接种疫苗前获得了有关研究参与者的年龄、性别和免疫状态特征的数据。然后,研究小组开发了计算模型来预测不同患者群体的疫苗反应。
“我们问,’你认为推动疫苗接种结果的最重要因素是什么?’”领导最近研究的LJI教授Bjoern Peters博士说。“我们的想法是让团队真正把钱花在刀刃上。”
该研究发表在《细胞报告方法》杂志上。
之前已经开发了多种用于预测疫苗反应的计算模型,其中许多模型基于疫苗接种前后免疫状态的复杂模式。令人惊讶的是,比赛中最好的预测因子是基于一个非常简单的相关性:抗体反应随着研究参与者的日历年龄而降低。
结果可能看起来是反高潮的,但竞争揭示了需要更多疫苗研究的地方。“我们知道日历年龄很重要,但我们仍然看到疫苗接种反应存在很多我们无法解释的差异,”彼得斯说。
该竞赛还有助于将科学家团结在进一步的百日咳芽孢杆菌疫苗研究上。在美国,百日咳芽孢杆菌疫苗在1990年代被重新配制,以解决相对较小的不良副作用。研究表明,较新的(aP疫苗)设计在预防疾病传播和感染方面可能不如较旧的(wP疫苗)设计有效。
“我们不知道目前的疫苗缺少什么,”彼得斯说。“这是一个悬而未决的问题。”
预测比赛正在成为一年一度的盛会,以前的参赛者已经回到数据中,以进一步磨练他们的预测。也许,彼得斯希望,仔细研究究竟是什么推动了年轻人更高的抗体反应,可以为所有患者群体带来更好的疫苗。
彼得斯说:“我们希望利用这次比赛,不仅作为检查人们预测疫苗接种结果的能力的一种方式,而且还作为解决重要公共卫生问题的一种方式。
Peters 实验室和 CMI-PB 团队目前正在完成他们的第二次受邀挑战。他们将在 2024 年 8 月左右举办公开比赛。研究人员可以通过此链接加入他们。
该研究的其他作者包括 Pramod Shinde、Ferran Soldevila、Joaquin Reyna、Minori Aoki、Mikkel Rasmussen、Lisa Willemsen、Mari Kojima、Brendan Ha、Jason A Greenbaum、James A Overton、Hector Guzman-Orozco、Somayeh Nili、Shelby Orfield、Jeremy P. Gygi、Ricardo da Silva Antunes、Alessandro Sette、Barry Grant、Lars Rønn Olsen、Anna Konstorum、Leying Guan、Ferhat Ay 和 Steven H. Kleinstein。
更多信息:Pramod Shinde 等人,用于开发和测试免疫计算模型的多组学系统疫苗学资源,Cell Reports Methods (2024)。DOI: 10.1016/j.crmeth.2024.100731.www.cell.com/cell-reports-meth……2667-2375(24)00056-0