How an HIV/AIDS tragedy spurred human evolution
在抗逆转录病毒药物传入南非之前,高死亡率塑造了免疫系统基因。

一项新研究表明,在强效抗艾滋病毒药物问世之前,艾滋病在南非的一个地区造成了极其严重的破坏,短短十几年间,就对人类基因组产生了影响,改变了免疫系统基因的频率。随着二十年前药物的普及,这种进化力量有所减弱,基因改变的速度也随之放缓。
这项研究令人震惊地展现了人类的快速进化。“太棒了,”亚利桑那大学研究艾滋病毒的进化生物学家迈克尔·沃罗贝(Michael Worobey)说道,他并未参与这项研究。“它清晰地展示了自然选择的作用,以及药物干预如何阻止自然选择的过程。”
研究人员评估了南非夸祖鲁-纳塔尔省(该国受艾滋病影响最严重的省份)人群的基因变化。目前,全球约有4080万艾滋病毒感染者,其中20%居住在南非。这项研究使用了1998年至2025年间采集的近1600名夸祖鲁-纳塔尔省母亲(包括感染和未感染艾滋病毒的母亲)及其400多名婴儿的血液样本。
牛津大学免疫学家菲利普·古尔德(Philip Goulder)领导了这项研究,该研究成果发表在今天的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。他表示,在 2005 年抗逆转录病毒药物(ARV)开始在夸祖鲁-纳塔尔省广泛应用之前 ,当地出现了一场“完美风暴”,多种不寻常的因素汇聚在一起,导致了一场毁灭性的疫情。在 20 世纪 90 年代初之前,艾滋病毒在南非的传播并不广泛,但随后疫情在异性恋人群中爆发,夸祖鲁-纳塔尔省约有 40%的孕妇感染了艾滋病毒。(这种惊人的高感染率至今仍然存在。)由于遗传因素、医疗保健的匮乏以及可能存在的病毒亚型等多种因素,感染者发展为艾滋病(即免疫系统被摧毁,生命受到威胁)的速度异常迅速,在南非仅需约 4.5 年,而北美则需要 10 年左右。
其他研究表明,包括疟疾和肺结核在内的传染病如何改变了人类基因组。但这些改变历经数千年。“这正是这项研究令人兴奋之处:你可以看到进化实际上可以发生得如此迅速,”古尔德说道。
类似的进化力量可能也曾在北美和欧洲发挥作用,但它们更难被察觉,也不太可能影响后代。这些地区的艾滋病毒感染率低于1%,受影响最严重的群体是男男性行为者。“他们通常不会留下那么多后代,”沃罗贝指出。
在夸祖鲁-纳塔尔省血液样本的 DNA 序列数据中,古尔德及其同事追踪了免疫系统最精妙、最有效的抗感染机制之一的变化。当细胞被 HIV 等病毒感染时,人类白细胞抗原(HLA)分子会将病毒片段携带到细胞表面,如同手一般,将这些病毒片段展示出来。免疫系统的“神枪手”——细胞毒性 T 淋巴细胞(CTL)会将这些片段识别为外来物并杀死受感染的细胞。这项研究的重点是编码 HLA 分子的基因的变异,即等位基因。
在艾滋病毒感染者体内,病毒会迅速进化出大量不同的突变体。一些 HLA 分子比其他分子更有效,它们携带所有变异株共有的 HIV 片段;而另一些 HLA 分子则更倾向于携带病毒中那些经常发生变化的片段,从而削弱细胞毒性 T 淋巴细胞(CTL)的防御能力。研究人员追踪了三种他们称之为“保护性”的 HLA 等位基因和三种他们称之为“易感性”的 HLA 等位基因的频率。
基于他们利用自身数据建立的模型,研究人员发现,携带任何易感等位基因的人口比例从 1990 年的 28%下降到 2004 年的 25%。沃罗贝解释说:“如果你杀死了很大一部分人口,他们就无法将这些基因留给后代了。” 同期,携带任何保护性等位基因的人口比例从 23%上升到 27%,这意味着幸存人口中更大比例的人能够产生强烈的细胞毒性 T 淋巴细胞(CTL)反应。该研究的共同作者、弗雷德里克国家癌症研究实验室专门研究人类白细胞抗原 (HLA) 的免疫学家玛丽·卡林顿表示,这些变化“虽然幅度不大,但很明显”。
抗逆转录病毒药物的出现(目前已覆盖约80%的南非艾滋病毒感染者)并未阻止这一进化趋势,但显著减缓了其速度。研究人员预测,到2035年,22%的人口将携带易感基因,32%的人口将携带保护性基因。研究表明,如果夸祖鲁-纳塔尔省的人口从未获得过抗逆转录病毒药物,到2035年,易感基因的流行率将从1990年的10个百分点下降至18%,而保护性基因的流行率将上升19个百分点至42%。乔治城大学医学院的进化生物学家托莫科·斯蒂恩表示,这是一个“有趣的反事实假设”。
斯蒂恩表示,从长远来看, HLA 频率中观察到的“定向选择”往往会被其他因素所掩盖。由于大多数等位基因在全球范围内分布,“迁徙历史而非选择似乎塑造了这些频率,”她说道。而且,由于维持不同的等位基因是有利的,因此所谓的平衡选择(它维持基因多样性)也抵消了许多定向选择的作用。
“任何基因的存在都是有原因的,”古尔德表示赞同。“事实上,几乎可以肯定的是,那些对艾滋病毒有害的基因对其他方面是有益的。只是我们目前还不知道而已。”
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