Newer testing methods suggest significant silent spread of measles in the US, threatening elimination
6 月，麻疹悄然蔓延至犹他州和亚利桑那州，当地卫生部门陆续收到报告，称有患者前来就诊，表示他们的孩子刚刚从全身皮疹中康复；也有家长告诉儿科医生，他们的全家刚刚从麻疹中康复。
但由于患者拒绝接受检测，直到 8 月 8 日，疫情才出现官方病例。当时，亚利桑那州莫哈韦县公共卫生部门收到一份报告，称一名 10 岁男孩居住在一个横跨亚利桑那州北部和犹他州南部边界的紧密社区中。
该疫情已发展至报告病例超过 600 例，目前是美国最活跃的疫情。亚利桑那州和犹他州的病例几乎肯定对确定美国是否失去麻疹消除状态至关重要，这意味着美国已连续一年多未在其境内常规传播麻疹病毒。做出这一决定的 会议定于 11 月举行。
美国疾病控制与预防中心指派一名疾病侦探利用分子证据——隐藏在感染患者的麻疹病毒基因组深处的线索——来了解更多关于疫情真正开始的时间和实际规模的信息。
去年美国报告的麻疹病例数激增至2267例，创下三十多年来的最高纪录。疫情传播并未放缓，仅今年前四个月病例数就超过1700例，病毒在那些放弃接种疫苗的社区中迅速蔓延。
追溯疫情爆发的源头
犹他州疫情爆发后不久，卫生官员就怀疑实际患者人数比他们知道的要多。
大多数疾病暴发都被低估了，因为医生可能漏诊不常见的疾病，而患者可能出于宗教或文化原因不寻求医疗救助。这两个因素似乎都在这次疫情中发挥作用。
麻疹在美国已经30年没有广泛传播了，因此许多医生从未见过病例。此外，麻疹传播的社区曾是耶稣基督末世圣徒原教旨主义教会一个分支的所在地，该教派有一位名叫沃伦·杰夫斯的魅力领袖，他散布了对疫苗的不信任。
麻疹疫苗非常有效。接种两剂疫苗，大约97%的情况下可以预防麻疹。由于麻疹病毒传染性极强，即使在人离开房间后，病毒仍可在空气中停留长达两小时，因此，一个地区的疫苗接种覆盖率必须很高（超过95%），才能阻止其传播。然而，虚假信息的传播以及公众对公共卫生官员缺乏信任，导致人群对麻疹病毒的保护率急剧下降。
据疫情爆发期间被派往亚利桑那州皮马县卫生部门的流行病情报服务官员安妮·王博士称，参与抗击疫情的公共卫生部门想知道，是否可以通过观察病毒基因组随时间的变化来估算疫情的真正开始时间和真实规模。
疫情情报专家组（EIS）成员是一群训练有素的公共卫生专家，他们通常被派往州和地方公共卫生部门协助进行疫情调查。王在周二举行的疾控中心年度疫情情报专家组会议上介绍了他们对此次疫情的调查结果。
这种追踪疫情源头的技术依赖于了解病毒在人际传播过程中遗传物质发生突变（或改变）的速度。麻疹病毒相对稳定，在传播过程中变化很小。但即使是这种相对稳定的病毒，在传播过程中也会出现微小的变化；只是需要付出额外的努力才能发现这些变化。
王教授解释说，通常人们只研究麻疹病毒基因组中用于识别毒株的一小部分，而她和同事们需要对病毒的整个基因组，也就是它的全部蓝图进行测序。他们对从165名患者身上采集的病毒样本进行了这项工作。
王说，他们利用这些信息，基本上确定了导致亚利桑那州和犹他州疫情爆发的病毒的诞生日期。
她说，这些早期感染可能至少在10岁男孩确诊前六周，甚至可能长达14个月就开始了。不过她补充说，由于他们只使用了在犹他州和亚利桑那州疫情中采集的病毒样本，因此无法确定最早病例的地理位置。去年，西德克萨斯州、南卡罗来纳州以及墨西哥和加拿大也爆发了规模较大的麻疹疫情。
然而，如果首次感染地点在美国，那么这项研究可能会有力地支持这样一种观点：麻疹已在美国持续传播超过一年，而一年是确定麻疹是否被消除的阈值。
王和她的团队还估计，亚利桑那州/犹他州的疫情规模至少是已知病例数的 6.5 倍。
更多证据表明存在隐性传播。
还有其他迹象表明，美国麻疹疫情的传播很大程度上没有被报道。
俄勒冈州一项独立的环境影响报告书调查发现，在去年10月至今年2月期间，该州24个监测县中的23个县共检测到100次麻疹病毒。同期，俄勒冈州报告了6例麻疹病例，但这些病例均发生在病毒监测区域之外。
“检测数量和传播范围表明，麻疹的传播范围比我们报告的六例病例要广，”俄勒冈州公共卫生局的流行病情报服务官员杰弗里·塔穆奇博士在一次会议上表示。
“这就引出了一个问题，为什么会有漏诊病例？是病人没有就医吗？是病人被诊断出患有其他疾病吗？是医务人员没有对出现临床症状的人进行检测吗？还是另有其他原因？”塔穆奇说，“我们目前还不确定，仍在努力寻找答案。”
消除风险状态
北卡罗来纳大学公共卫生杰出教授诺埃尔·布鲁尔博士表示，美国疾病控制与预防中心正在进行一项全国性的分析，类似于在亚利桑那州和犹他州进行的分析，研究基因组数据。
布鲁尔表示：“各州提供的数据很有用，但存在一些重要的局限性，例如无法确定与其他州疫情爆发的关联性。”他还补充说，他了解亚利桑那州和犹他州的数据。他还提到，另一个州也在进行基因组分析。
布鲁尔担任委员会主席，该委员会将核实美国疾病控制与预防中心（CDC）的报告，并就麻疹消除状况向泛美卫生组织（PAHO）提供意见。泛美卫生组织将于今年秋季做出最终决定。该委员会由非营利组织全球健康工作组召集，并由美国疾病控制与预防中心提供资金支持。
布鲁尔预计疾控中心将在 6 月底发布报告，并预计数据将令人信服且具有决定性。
他说：“无论法医流行病学能否找到将这些病例联系起来的确凿证据，麻疹现在已在美国广泛传播，而且没有迹象表明它会在短期内结束。”
4 月初，美国疾病控制与预防中心（CDC）的科学家公布了去年在美国流行的约 1000 株麻疹病毒的首批大型基因测序数据。CDC 将利用这些信息来确定德克萨斯州、亚利桑那州和犹他州以及南卡罗来纳州、佛罗里达州和华盛顿州的麻疹疫情是否相互关联，还是分别由美国境外病毒传入所致。
“从美国、加拿大和其他地方的更大数据集来看，很明显，犹他州和亚利桑那州正在发生的事情与美国之前的疫情密切相关，并与德克萨斯州、新墨西哥州和其他地方有明显的联系，”斯克里普斯研究所的进化生物学家克里斯蒂安·安德森博士说。他虽然没有参与序列分析工作，但一直在密切关注此事。
安德森在一封电子邮件中表示：“南卡罗来纳州、华盛顿州和其他地方的大规模疫情属于一个独立的分支，但显然也是由美国（和加拿大）境内的地方性传播引起的，而不是像我们从美国卫生与公众服务部官员那里听到的那样，是由‘移民’或其他入境人员造成的。”
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