肺炎克雷伯菌：一种机会性病原体，对某些人无害，但对另一些人造成严重疾病
肺炎克雷伯菌是一种常见的细菌，存在于我们体内，甚至可能潜伏在您的肠道、口腔或鼻子中。但它也是一种臭名昭著的有害细菌，会让我们病得很重。
它是美国医院获得性肺炎的最常见原因，也是全球尿路感染的第二大常见原因，仅次于大肠杆菌（大肠杆菌）。如果感染伤口或进入血液，肺炎克雷伯菌可引起血流感染和败血症。
那么，肺炎克雷伯菌如何在我们中的一些人的微生物组中无害地生活，却在其他人中引起疾病呢？了解这一点可能是预防感染的关键。
科学家们并不完全确定有多少人口携带肺炎克雷伯菌作为其正常肠道微生物组的一部分。过去的尝试结果千差万别。
例如，一项针对健康人的调查在近 4% 的粪便样本中检测到肺炎克雷伯菌。然而，其他研究表明，肺炎克雷伯菌在某些群体中明显更常见，包括住院患者、生活在低收入国家的人，尤其是去过亚洲的人。
肺炎克雷伯菌是一种机会性病原体。这意味着，当作为正常微生物群的一部分携带到肠道、鼻子或口腔中时，肺炎克雷伯菌不会引起任何健康问题，除非一个人的免疫系统因感染或疾病而受到损害。因此，我们的微生物组可以充当肺炎克雷伯菌的储存库，它可以从中扩散到身体的其他部位并引起感染。
一项针对澳大利亚一家医院 498 名重症监护患者的研究发现，一半的肺炎克雷伯菌感染是由患者自己的肺炎克雷伯菌菌株引起的，该菌株已经存在于他们的肠道或喉咙中。
人们认为肺炎克雷伯菌可以通过呼吸机等医疗设备从肠道传播到身体的其他部位。最近在其他引起肺炎的细菌物种中观察到这种类型的肠肺易位，例如铜绿假单胞菌。手术还可以使肺炎克雷伯菌扩散到可能引起感染的部位。
阻止传播
不幸的是，一些肺炎克雷伯菌菌株已经产生了高水平的耐药性。这意味着一些曾经用于治疗肺炎克雷伯菌感染的药物现在不再有效。
特别令人担忧的是，一些肺炎克雷伯菌菌株正在对称为碳青霉烯类的抗生素产生耐药性，这些抗生素通常仅在其他抗生素不起作用时用作最后的治疗方法。而且，这种抵抗在人群中变得越来越普遍。
迫切需要开发抗生素的替代品，以便预防或治疗耐药性肺炎克雷伯菌病例。我们实验室的研究重点是利用肠道微生物组作为潜在的解决方案。
由于肠道中携带肺炎克雷伯菌是后续感染的已知危险因素，因此避免这种情况的一种途径可能是操纵微生物组。这可以通过使用含有有益细菌种类的益生菌来限制肠道中的肺炎克雷伯菌来完成。这种解决方案对于医院或疗养院的人们尤其重要，因为肺炎克雷伯菌更普遍，感染风险最高。
长期以来，人们一直认为微生物组通过一种称为定植抗性的特性为宿主提供一定程度的自然保护，防止感染。这是当常驻肠道细菌胜过进入的物种（包括潜在的病原体）并阻止它们在肠道中建立时。
但微生物组差异很大，有些人比其他人携带更多的保护性微生物群落。
我和我的同事们想知道为什么一些肠道群落可以抵抗有害细菌的生长，而另一些则不能。在实验室中，我们将人类肠道细菌组合成包含不同多样性和细菌物种组成的群落。然后，我们用肺炎克雷伯菌（以及其他有害细菌，如沙门氏菌）挑战这些社区。
我们发现，多样化的肠道微生物组对肺炎克雷伯菌定植更具保护作用。我们发现，这种保护是由于常驻的肠道细菌消耗了入侵微生物生长所需的营养。这促使我们开发了一种预测肠道细菌组合的方法，这种组合可以抵抗不需要的细菌物种（如肺炎克雷伯菌）的生长。
我们才刚刚开始了解微生物在我们的健康方面所起的作用。其中一些微生物，如肺炎克雷伯菌，甚至可以同时是有害的和无害的。研究肠道微生物群成员之间的相互作用是微生物组科学家研究的一个关键领域，因为它可能导致预防或治疗感染的新方法。
