这项研究发表在上周的《自然医学》，研究小组从过去67年的64个国家的GenBank中提取了6585个mpox序列，从GISAID中提取了3914个。

进化枝B.1导致全球爆发

Mpox病毒在遗传学上分为进化枝1和2，并进一步分为亚进化枝2a和2b.6。主要通过密切接触传播的人畜共患(在动物和人之间传播)感染的特征是发热和皮肤或粘膜损伤。

“猴痘病毒(MPXV)在西部和中部非洲流行，2022年5月，一个进化枝IIb谱系(B.1)在非洲以外引起了全球爆发，导致在116个国家/地区发现了它，”研究作者指出。

截至2024年8月12日，这场主要由男男性行为者之间的性传播引发的疫情已导致99176人感染，208人死亡，病死率为0.21%。

进化枝2b，B.1仅在人类中取样的谱系

几乎所有(97.7%) mpox序列都聚集在谱系B.1中，代表了全球疫情期间的密集基因组测序。进化枝1、2a和2b A的测序频率要低得多。mpox序列的绝大多数(98.6%)是在2022年至2024年收集的，历史监测有限，导致1958年至2015年多年没有序列分析。

分别在1958年和1970年首次发现了亚分类2a和1，并且这些分类继续传播。从2022年到2024年，在刚果民主共和国(DRC)、苏丹和邻近的非洲国家发现了clade 1，其中2024例DRC病例与一个新的不同谱系有关，该谱系显示南基伍存在人际传播的迹象。

自2018年以来就没有见过进化枝2a，除了1971年的一个样本外，所有进化枝2b的基因组都是在2017年至2023年期间采样的。进化枝2b A于2017年首次在尼日利亚发现，并至少持续到2023年在人类中传播。后裔血统B.1最早出现在2022年。

迄今为止，进化枝2b A和B.1谱系仅在人类中取样。几乎所有(96%)的进化枝1序列都在人类中进行了采样，其中单一样本来自圈养黑猩猩、野生鼩鼱和绳松鼠。然而，在1970年(2个样本)和2003年(1)，只有12%的进化枝2a样本来自人类。

大多数进化枝2a样本(60%)来自黑猩猩，黑猩猩可能是溢出宿主而不是储存者，一些样本是从丹麦和美国的野生乌鸫、食蟹猴和草原犬鼠中分离出来的。

进化枝1主要从刚果盆地分离，在刚果民主共和国、刚果共和国、中非共和国、喀麦隆和加蓬取样。基因组分析表明，进化枝1被多次引入该区域。

现在是改善监控的时候了

随着时间的推移，系统进化树的重建表明，进化枝1最近的共同祖先出现在1917年。研究人员注意到，在过去30年中，clade 1病毒经常在国际和省际之间传播，在刚果民主共和国不同省份看到的病毒之间的遗传相关性非常相似，这表明病毒有规律地迁移。

现在是加强mpox监测的时候了，包括在非洲，重点关注高危人群，并确保与现有系统整合，以确保提供全面和无缝的护理。

苏丹进化枝1序列在1978年从它们最近的亲戚(1985年刚果民主共和国样本)中分离出来，可能在动物宿主中传播，这是由于其8.5%的突变率，类似于动物中预期的8%，但远低于人类进化中预期的85%。2022年在该国确认的18例mpox病例在苏丹东部六个州的传播证实了这一发现。

虽然进化枝2a和2b A都在西非传播，并已出口到其他地区，但自2003年美国爆发以来，尚未在西非以外发现2a。进化枝2b首先在尼日利亚传播，然后传播到欧洲、亚洲、北美和北非的国家。

国家和省份中不同进化枝1谱系的共循环表明，进化枝1动物宿主中广泛的mpox多样性持续存在，这表明mpox的高患病率以及当人类与宿主宿主相互作用时频繁溢出的可能性。

“还不清楚谱系B.1的特征是否是在人类适应后获得的，或者它们是否可以在MPXV分支中推广，”作者写道。“这只能通过更强的监测、序列共享和持续的分支和谱系间差异的基因型和功能表征来揭示。”

他们呼吁更多的实验室致力于表征mpox分支和谱系，并呼吁各国继续记录和共享病毒序列，优先考虑靶向和代表性测序的样本。

“这将有助于跟踪病毒的传播和进化，”研究人员写道。“如果我们想防止下一次mpox全球爆发，现在就应该加强mpox监测，包括在非洲，重点关注高危人群，并确保与现有系统整合，以确保全面、无缝地提供护理。”