无家可归者营地附近的废水检测显示 COVID-19 病毒突变
杰夫·杜德/ Flickr cc
在 COVID-19 大流行期间，废水检测已成为病毒监测的标志，一项新的研究着眼于在无家可归者营地附近收集的样本，揭示了新的病毒突变和传播模式，以及 26% 的水样含有 SARS-CoV-2 遗传物质。该研究今天发表在《环境科学与技术快报》上。
传统的废水监测依赖于来自当地污水基础设施的检测样本，这些基础设施为家庭和公寓楼提供服务。SARS-CoV-2 感染者在感染开始时和初次感染后长达 7 个月内从粪便中排出最大病毒 RNA 水平。先前的研究表明，废水样本已经预测了某个地点的COVID-19活动何时激增，并确定了令人担忧的变体。
为了捕捉无家可归者的这些变化，研究人员需要对营地附近的水道进行采样，而不是传统的污水管线。在本研究中，从 2021 年 12 月到 2022 年 7 月对拉斯维加斯郊外营地附近的水进行了采样。
作者说，科学家从已知受无家可归者影响的防洪基础设施中收集了水。
26%的样本含有SARS-CoV-2 RNA
他们发现，在获得的 57 个样本中，有 15 个 （26.3%） 含有可检测水平的 SARS-CoV-2 RNA，浓度在 2022 年 1 月和 2 月最高，这与拉斯维加斯的 Omicron 活动峰值相对应。
“这些结果表明，来自受无庇护个体影响的防洪渠道的环境水样似乎含有在更广泛的社区中传播的相同SARS-CoV-2变体……带有来自先前传播的变体的一些间歇性信号，“作者写道。
这些结果表明，来自受无庇护个体影响的防洪渠道的环境水样似乎含有在更广泛的社区中传播的相同SARS-CoV-2变体。
在随后的全基因组测序中，作者在水道中发现了SARS-CoV-2变体。几乎所有的变体都与传统污水处理基础设施中的变体相匹配。他们指出：“然而，我们还在 2022 年 1 月收集的环境水样中检测到 22 个特定于 Alpha 变体的突变中的 10 个——在 Alpha 感染高峰一年后。
对病毒序列的分析发现了三种新的病毒刺突蛋白突变，但作者表示，没有足够的信息来确定这些突变是否改变了营地中COVID-19患者的临床结果。
“由于缺乏对无庇护个体的临床监测数据，我们无法直接将环境水样的变异流行率与这一特定人群进行比较，”作者说。