Expanding Viral Genomic Sequencing Infrastructure in the US
一瞥
流感病毒每年大量传播，并且不断变化。了解什么样的病毒在传播以及在哪里传播对公共卫生决策至关重要。通过与公共卫生实验室协会的合作协议，CDC向国家实验室网络提供资金和广泛的培训，帮助他们进行流感测序。
国家流感参考中心
CDC资助三个州公共卫生实验室作为国家流感参考中心。其中包括以下内容:
- 加州公共卫生部病毒和立克次体疾病实验室
- 纽约州卫生部(沃兹沃斯中心)
- 威斯康星州立卫生实验室
美国的每个州都会将流感病毒样本送到这三个实验室中的一个进行基因组测序。自2014年以来，NIRCs和CDC联合提供了近60，000种流感病毒的测序数据，并将这些数据公之于众，以更好地为全球流感检测、预防和控制工作提供信息。每个NIRC在每个流感季节对近1000种流感病毒进行测序，并对这些病毒进行病毒分离，以帮助CDC评估疫苗相关性和抗病毒有效性。
流感测序中心
从2021年开始，CDC和APHL试行了流感测序中心(ISC)计划，截至2024年，支持了6个isc。其中包括以下内容:
- 科罗拉多州公共卫生与环境部
- 佛罗里达公共卫生实验室部
- 夏威夷州卫生部
- 马萨诸塞州公共卫生部
- 明尼苏达州卫生部
- 德克萨斯州健康服务部
这些公共卫生实验室被装备成每年对大约500种流感病毒进行测序，并被战略性地放置在美国各地，以确保尽可能多的病毒种类(例如，在地理上多样化的高旅行或大都市地区)。ISCs与CDC共享数据，以快速识别具有可能逃避疫苗保护的基因差异的病毒，更新季节性流感疫苗，并确保其保护人类和拯救生命的能力。