国际科学家提议增加登革热病毒分类系统

International scientists propose additions to dengue virus classification system

新闻简报
蚊虫叮咬的人
詹姆斯·加塔尼 / CDC

由耶鲁大学公共卫生学院领导的一个国际专家组提议在当前的登革热病毒(DENV)命名法中增加两个子分类,以帮助识别和跟踪具有潜在流行病学或临床重要性的毒株。

拟议的补充发表在预印本服务器medRxiv上,将蚊媒病毒的当前基因型分为“主要”和“次要”谱系,以提供更多的时空细节,提供将谱系分配给序列数据的方法,并提出新的谱系。

他们写道,DENV“目前正在流行环境中造成前所未有的流行病,并扩展到新的地理区域。“因此,使用基因组监测来追踪这种病毒至关重要。然而,病毒基因组多样性的复杂模式使得使用现有的基因型分类系统具有挑战性。

添加可能会改善小组间的沟通

在一个网站上,研究人员描述了他们的分类分配工具以及如何使用它。他们还更新了病毒基因型定义,以减少未分配或无定形归类为“相关”的基因组数量。

当务之急是要有一种精确和通用的语言来监测不同时空尺度上的持续DENV传播;并且这可以传染给可能没有基因组学背景的临床医生和公共卫生官员。

该团队表示,增加的主要和次要谱系将有助于国家和研究小组层面对相关登革热病毒多样性的讨论。

“随着最终可能选择特定病毒谱系的干预措施(例如疫苗、沃尔巴克氏体感染的蚊子)的实施,必须有一种精确和通用的语言来监测不同时空尺度上的持续登革热病毒传播;并且这可以传染给可能没有基因组学背景的临床医生和公共卫生官员,“该研究的作者写道。

“此外,拟议的谱系对于使用部分基因组序列进行分类是稳健的,”他们补充道。

International scientists propose additions to dengue virus classification system | CIDRAP (umn.edu)

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